如何配置StringTie

2020-11-04 17:16:12

StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因，可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）专用软件来处理StringTie的输出。

HTSeq是什么

2020-11-04 17:13:59

HTSeq是使用Python编写的一支用于进行基因Count表达量分析的软件，能根据SAM/BAM比对结果文件和基因结构注释GTF文件得到基因水平的Counts表达量。HTSeq进行Counts计算的原理简单易懂，容易上手。

gvcftools是什么

2020-11-04 16:53:03

gvcftools是用于创建和分析gVCF文件的小型实用程序包

什么是GATK?

2020-11-04 16:48:09

GATK全称Genome Anlysis Toolkit，是一套用于分析基因组的工具箱。主要功能是寻找变异位点和基因分型，用于从sequencing数据中进行variant calling，包括SNP、INDEL。

BreakDancer是什么

2020-11-04 16:34:11

BreakDancer是一个C++软件包，可提供下一代配对末端测序读取的全基因组结构变异检测。它包括两个补充程序，BreakDancerMax预测五种类型的结构变异；BreakDancerMini专注于使用正态映射的读取对检测小插入缺失。

bedtools如何配置

2020-11-04 16:24:00

bedtools实用程序是用于处理基因组信息分析的强大工具集合。例如，bedtools允许人们以广泛使用的基因组文件格式（ 例如BAM，BED，GFF/ GTF，VCF）与多个文件中的基因组间隔相交，合并，计数，互补和混洗。虽然每个工具都设计为执行相对简单的任务（例如，将两个间隔文件相交），但可以通过在UNIX命令行上组合多个bedtools操作来进行相当复杂的分析。

BCFtools是什么

2020-11-04 15:59:12

BCFtools是一组实用程序，以Variant Call Format（VCF）及其二进制副本BCF处理变量调用。所有命令都可以与未压缩和BGZF压缩的VCF和BCF透明地一起使用。

文字识别服务使用视频教程

2020-11-04 15:39:36

本视频主要为您介绍华为云 文字识别 服务如何开通服务、获取访问密钥以及使用SDK的操作视频教程：场景描述：华为云文字识别服务以Restful API的方式提供给用户使用。用户需要申请开通后，才能使用文字识别服务。

NAT网关使用SNAT访问公网操作视频教程

2020-11-04 15:32:56

本视频主要为你介绍华为云NTA网关服务使用SNAT访问公网的操作视频教程： 场景描述： NTA网关能够为 虚拟私有云 内的云主机提供 网络地址转换 服务，使多个主机可以共享 弹性公网IP 访问Internet。 当VPC内的云主机需要访问公网，为了节省弹性 公网IP 资源，并且为避免云主机IP直接暴露在公网上，您可以使用NTA网关的SNAT功能。 云NTA网关服务使用SNAT访问公网操作步骤

IoT云服务设备在线调试指导视频教程

2020-11-04 15:22:40

本视频主要为您介绍IoT云服务中设备在线调试指导的操作视频教程：通过实操教程，让您快速了解并上手IOT云服务设备的在线调试操作。

miRanda是什么

2020-11-03 16:31:07

miRanda是一种用于寻找microRNA基因组标靶的算法。该算法有C语言编写，可视作GPL下的开源方法使用。

什么是goseq

2020-11-03 16:28:26

goseq是R语言软件包，用于寻找GO terms，即基因富集分析。

GMAP是什么

2020-11-03 16:13:46

mRNA和EST序列的基因组定位和比对程序

edgeR是什么

2020-11-03 16:03:07

edgeR是R语言软件包，主要用于DNA测序技术产生的计数数据差异分析。特别是设计用于RNA-Seq或SAGE数据的差异表达分析。

什么是DEXSeq

2020-11-03 16:00:36

DEXSeq是R语言软件包，主要通过样品之间RNA-seq外显子计数实验设计来发现外显子的差异。

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